Gli ostacoli intermedi sono fattori che causano sfide agli animali migratori o impediscono loro di raggiungere il loro obiettivo. Esempi di ostacoli intermedi includono montagne, foreste, deserti, città e specchi d'acqua. Alcune di queste barriere bloccano la migrazione di alcune specie mentre non rallentano affatto altre specie. Ad esempio, un grande deserto può impedire agli anfibi o agli insetti di completare la loro migrazione mentre gli uccelli lo sorvolano.
Gli uccelli sono alcuni dei migranti più conosciuti e sono particolarmente abili in questa pratica. Perché la maggior parte degli uccelli vola così bene che riescono semplicemente a superare la maggior parte degli ostacoli che si frappongono. Tuttavia, non tutti gli uccelli possono attraversare i grandi oceani e molti sono limitati a luoghi accessibili via terra. Le montagne possono anche fornire barriere significative agli uccelli che non possono sorvolarle. Le città e i fiumi del deserto rappresentano importanti barriere alle migrazioni dei mammiferi e spesso i mammiferi devono viaggiare molto più lontano per aggirare tali ostacoli.
Gli esseri umani possono incontrare ostacoli anche durante i viaggi migratori. I deserti e le montagne sono particolarmente difficili da attraversare per gli esseri umani, mentre le foreste e le città sono facili da attraversare per gli esseri umani. Nel corso del tempo gli esseri umani spesso costruirono insediamenti vicino a caratteristiche così impegnative come ultima tappa in cui i viaggiatori potevano rifornirsi e riposarsi prima di affrontare viaggi difficili.
